产品编号:BLGE146
产品规格:
产品组成 | BLGE146-01(125rxn) | BLGE146-02(500rxn) | BLGE146-03(2500rxn) |
2×PreMix (SYBR Green, blue) | 1.25ml | 4×1.25ml | 5×BLGE146-02 |
50×ROX Reference Dye | 250µl | 1ml | 5×BLGE146-02 |
40×Dilution Buffer (Yellow) | 1.25ml | 1.25ml | 5×BLGE146-02 |
RNase-Free ddH2O | 2×1ml | 5×1ml | 5×BLGE146-02 |
说明书 |
产品情况:Color PreMix Kit(SYBR Green)试剂盒选用Real Time PCR专用试剂进行SYBR Green I 嵌合荧光法qPCR反应,核心成分为高效化学修饰、新型抗体法制备、耐热Taq DNA聚合酶。为充分发挥热启动酶特异性强、灵敏度高的特点,本品配套改良了缓冲液体系,使其更具扩增速率快、得率高、特异性强和可信区间宽的优势,对不同丰度、来源的靶基因都极为适用。
产品特色如下:额外添加了蓝色指示剂与黄色样本稀释液,将有利于大量样品的稀释和加样,减少操作误差;Buffer体系中平衡了K+和NH4+的比例,从而增加了扩增的可信区间、稳定性和特异性;预混液中只需加入模板、引物、RNase-Free ddH2O便可进行Real Time PCR反应,操作简单方便、快捷;ROX Reference Dye可方便用户选用针对不同型号的荧光定量PCR仪,本品的核心组分能充分消除信号本底、校正孔、批间差等带来的荧光信号误差。
储存运输:本品需在-30~-15℃条件下避光保存;运输条件应≤0℃。
本品解冻后,可在2~8℃避光条件下稳定存放3-6个月。
注意事项:
(一)实验前,待使用的2×PreMix和50×ROX Reference Dye请充分解冻。2×PreMix解冻后可能会出现少许白色沉淀,请室温放置2min并轻柔颠倒混匀,待溶液成分完全均一后再行使用;
(二)解冻后如未使用,须彻底混匀后重新冻存;非均一的混合液在冻融过程中,会形成的盐晶体出现分层、析出现象,对酶活性造成损害;
(三)PCR反应的预变性条件必须设定为95℃ 15min,用以充分激活耐热聚合酶;
(四)PCR反应液中各颜色指示剂终浓度应为1×,请根据模板的用量计算Dilution Buffer的使用量;
(五)20 μl反应体系中,建议基因组DNA或cDNA模板使用量≤100ng;逆转录产物作为模板时,使用量应≤PCR体系终体积的10%;当模板浓度较低时,可直接用cDNA原液作为模板使用,未稀释的模板不会影响定量结果;
(六)避免反复冻融;本品含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制时应避免强光照射;
(七)使用前,可上下颠倒或快速离心以充分混匀试剂,请不要使用涡旋仪避免出现泡沫;
(八)引物终浓度为0.3μM时,扩增效果最为稳定;如需要进一步优化,可以在0.2-0.5μM范围内微调引物浓度。
实验流程:
(一)自备产品
RNase-free 1.5ml离心管、PCR管、移液器及吸头、PCR仪、冰或移动冰盒
(二)实验准备
1.设定各相应规格的反应体系;
2.解冻模板、引物、2×PreMix、50×ROX Reference Dye、40×Dilution Buffer和RNase-Free ddH2O;并将所有试剂在室温条件下平衡、混匀。
(三)Real Time PCR反应液的配制
1.在qPCR管中配制以下溶液A,冰上操作:
384孔反应体系:
组分 | 终浓度 | 5 μl体系 | 10 μl体系 | 15 μl体系 | 20 μl体系 |
2×PreMix | 1× | 2.5 μl | 5 μl | 7.5 μl | 10 μl |
正向引物(10 μM) | 0.3μM◎ | 0.15 μl | 0.3 μl | 0.45 μl | 0.6 μl |
反向引物(10 μM) | 0.3μM◎ | 0.15 μl | 0.3 μl | 0.45 μl | 0.6 μl |
cDNA模板★ | pg~ng | / | / | / | / |
50×ROX Reference Dye◆ | / | / | / | / | / |
RNase-free ddH2O | / | 至5 μl | 至10 μl | 至15 μl | 至20 μl |
组分 | 终浓度 | 20μl体系 | 25μl体系 | 50μl体系 |
2×PreMix | 1× | 10μl | 12.5μl | 25μl |
正向引物(10μM) | 0.3μM◎ | 0.6μl | 0.75μl | 1.5μl |
反向引物(10μM) | 0.3μM◎ | 0.6μl | 0.75μl | 1.5μl |
cDNA模板★ | pg~ng | / | / | / |
50×ROX Reference Dye◆ | / | / | / | / |
RNase-free ddH2O | / | 至20μl | 至25μl | 至50μl |
2.确认常见仪器匹配的ROX Reference Dye的浓度
仪器 | 终浓度 |
ABI7500/7500 Fast/ViiA 7;QuantStudio™;12K Flex;Agilent Mx3000P/Mx3005P/Mx4000 | 1×(如1 μl ROX/50μl体系) |
ABI 5700/7000/7300/7700/7900HT/StepOneTM/StepOne PlusTM | 1×(如1 μl ROX/50μl体系) |
Roche仪器;Bio-Rad仪器;Eppendorf仪器等 | 无需添加 |
★将cDNA模板与40×Dilution Buffer按一定比例混合成稀释模板,使Dilution Buffer在定量体系中的终浓度为1×。
◆常见仪器匹配的ROX Reference Dye的浓度,见上表。
(四)进行Real time PCR反应
1.两步扩增法(常规方法)
反应 | 循环 | 温度 | 时间 | 原理 | 荧光信号 |
预变性 | 1× | 95°C | 15min | 预变性 | 不采集 |
PCR | 40× | 95°C | 10sec | 变性 | 不采集 |
60-66°C♣1 | 20-32sec* | 退火/延伸 | 采集 | ||
熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage) |
2.三步扩增法(模板浓度和引物Tm值低、非特异扩增强、扩增曲线重复性差等时,可采用该法)
反应 | 循环 | 温度 | 时间 | 原理 | 荧光信号 |
预变性 | 1× | 95°C | 15min | 预变性 | 不采集 |
PCR | 40× | 95°C | 10sec | 变性 | 不采集 |
50-60°C♣2 | 20sec | 退火 | 不采集 | ||
72°C | 20-32sec* | 延伸 | 采集 | ||
熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage) |
3.请按照仪器使用说明书进行实验操作,不同型号仪器的时间设定*如下,
Roche LightCycler/ LightCycler 480 | 20sec |
ABI 7500 Fast/7900HT/7900HT Fast/ViiA 7;StepOne/StepOnePlus | 30sec |
ABI 7000/7300 | 31sec |
ABI 7500 | 32sec |
♣2 常规引物退火温度比引物的解链温度(Tm)低5℃,如引物碱基数较少,可适当提高退火温度提高PCR特异性;如果碱基数较多,则可适当减低退火温度。
4.盖上反应管,并瞬时离心确保组成混匀。
5.将反应体系置于荧光定量PCR仪中,开始反应。
常见问题及处理方案:
无扩增曲线出现 |
A.反应循环数不够; B.反应循环数过多,增加背景信号; C.程序中未设置信号采集步骤; D.引物降解; E.模板浓度过低; F.模板降解。 |
扩增曲线异常 |
A.曲线不光滑:需提高模板浓度重复实验,或确认ROX与机型是否匹配; B.曲线断裂或下滑:需调整模板浓度,或减小基线终点,重新分析数据; C.曲线骤降:检查反应管内是否有气泡。 |
CT值异常 |
A.出现太晚 (1)尝试三步扩增法,优化反应条件或重新设计引物,提高扩增效率; (2)减少稀释度重复实验,提高模板浓度; (3)重新制备模板,确认模板是否降解; (4)评估PCR产品是否在80~150bp,防止过长; (5)加到模板稀释倍数,或重新制备模板重复实验,防止体系中存在由模板带入的PCR抑制剂。 B.阴性对照中出现扩增带 (1)反应体系污染; (2)引物二聚体干扰。 |
熔解曲线异常 |
A.引物设计不适宜; B.引物浓度过高; C.cDNA模板有基因组污染。 |
实验重复性差 |
A.加样误差; B.标准品降解; C.模板浓度不适宜; E.PCR仪模块内置温度不一致。 |