产品名称:彩色荧光定量预混试剂盒(SYBR Green)
产品编号:BLGE146
产品规格:
产品组成 BLGE146-01(125rxn) BLGE146-02(500rxn) BLGE146-03(2500rxn)
2×PreMix (SYBR Green, blue) 1.25ml 4×1.25ml 5×BLGE146-02
50×ROX Reference Dye 250µl 1ml 5×BLGE146-02
40×Dilution Buffer (Yellow) 1.25ml 1.25ml 5×BLGE146-02
RNase-Free ddH2O 2×1ml 5×1ml 5×BLGE146-02

说明书

产品情况:Color PreMix Kit(SYBR Green)试剂盒选用Real Time PCR专用试剂进行SYBR Green I 嵌合荧光法qPCR反应,核心成分为高效化学修饰、新型抗体法制备、耐热Taq DNA聚合酶。为充分发挥热启动酶特异性强、灵敏度高的特点,本品配套改良了缓冲液体系,使其更具扩增速率快、得率高、特异性强和可信区间宽的优势,对不同丰度、来源的靶基因都极为适用。
产品特色如下:额外添加了蓝色指示剂与黄色样本稀释液,将有利于大量样品的稀释和加样,减少操作误差;Buffer体系中平衡了K+和NH4+的比例,从而增加了扩增的可信区间、稳定性和特异性;预混液中只需加入模板、引物、RNase-Free ddH2O便可进行Real Time PCR反应,操作简单方便、快捷;ROX Reference Dye可方便用户选用针对不同型号的荧光定量PCR仪,本品的核心组分能充分消除信号本底、校正孔、批间差等带来的荧光信号误差。

储存运输:本品需在-30~-15℃条件下避光保存;运输条件应≤0℃。
                          本品解冻后,可在2~8℃避光条件下稳定存放3-6个月。

注意事项:
(一)实验前,待使用的2×PreMix和50×ROX Reference Dye请充分解冻。2×PreMix解冻后可能会出现少许白色沉淀,请室温放置2min并轻柔颠倒混匀,待溶液成分完全均一后再行使用;
(二)解冻后如未使用,须彻底混匀后重新冻存;非均一的混合液在冻融过程中,会形成的盐晶体出现分层、析出现象,对酶活性造成损害;
(三)PCR反应的预变性条件必须设定为95℃ 15min,用以充分激活耐热聚合酶;
(四)PCR反应液中各颜色指示剂终浓度应为1×,请根据模板的用量计算Dilution Buffer的使用量;
(五)20 μl反应体系中,建议基因组DNA或cDNA模板使用量≤100ng;逆转录产物作为模板时,使用量应≤PCR体系终体积的10%;当模板浓度较低时,可直接用cDNA原液作为模板使用,未稀释的模板不会影响定量结果;
(六)避免反复冻融;本品含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制时应避免强光照射;
(七)使用前,可上下颠倒或快速离心以充分混匀试剂,请不要使用涡旋仪避免出现泡沫;
(八)引物终浓度为0.3μM时,扩增效果最为稳定;如需要进一步优化,可以在0.2-0.5μM范围内微调引物浓度。

实验流程:
(一)自备产品
           RNase-free 1.5ml离心管、PCR管、移液器及吸头、PCR仪、冰或移动冰盒
(二)实验准备
          1.设定各相应规格的反应体系;
          2.解冻模板、引物、2×PreMix、50×ROX Reference Dye、40×Dilution Buffer和RNase-Free ddH2O;并将所有试剂在室温条件下平衡、混匀。
(三)Real Time PCR反应液的配制
          1.在qPCR管中配制以下溶液A,冰上操作:
           384孔反应体系: 
组分 终浓度 5 μl体系 10 μl体系 15 μl体系 20 μl体系
2×PreMix 2.5 μl 5 μl 7.5 μl 10 μl
正向引物(10 μM) 0.3μM◎ 0.15 μl 0.3 μl 0.45 μl 0.6 μl
反向引物(10 μM) 0.3μM◎ 0.15 μl 0.3 μl 0.45 μl 0.6 μl
cDNA模板 pg~ng / / / /
50×ROX Reference Dye◆ / / / / /
RNase-free ddH2O / 至5 μl 至10 μl 至15 μl 至20 μl
           96孔反应体系:
组分 终浓度 20μl体系 25μl体系 50μl体系
2×PreMix 10μl 12.5μl 25μl
正向引物(10μM) 0.3μM◎ 0.6μl 0.75μl 1.5μl
反向引物(10μM) 0.3μM◎ 0.6μl 0.75μl 1.5μl
cDNA模板 pg~ng / / /
50×ROX Reference Dye◆ / / / /
RNase-free ddH2O / 至20μl 至25μl 至50μl
注意:2×PreMix为蓝色;40×Dilution Buffer为黄色;稀释模板后,最终反应体系应为绿色。如颜色不符,请确认反应体系中加入组分是否正确。
          2.确认常见仪器匹配的ROX Reference Dye的浓度
仪器 终浓度
ABI7500/7500 Fast/ViiA 7;QuantStudio™;12K Flex;Agilent Mx3000P/Mx3005P/Mx4000 1×(如1 μl ROX/50μl体系)
ABI 5700/7000/7300/7700/7900HT/StepOneTM/StepOne PlusTM 1×(如1 μl ROX/50μl体系)
Roche仪器;Bio-Rad仪器;Eppendorf仪器等 无需添加
注意:◎0.3μM的引物终浓度最为适宜。可增加浓度提高扩增效率;减少浓度降低非特异性扩增;建议在0.2-0.5μM范围内优化引物用量。
          ★将cDNA模板与40×Dilution Buffer按一定比例混合成稀释模板,使Dilution Buffer在定量体系中的终浓度为1×。
          ◆常见仪器匹配的ROX Reference Dye的浓度,见上表。
(四)进行Real time PCR反应
           1.两步扩增法(常规方法)
反应 循环 温度 时间 原理 荧光信号
预变性 95°C 15min 预变性 不采集
PCR 40× 95°C 10sec 变性 不采集
60-66°C♣1 20-32sec* 退火/延伸 采集
熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage)
           
           2.三步扩增法(模板浓度和引物Tm值低、非特异扩增强、扩增曲线重复性差等时,可采用该法)
反应 循环 温度 时间 原理 荧光信号
预变性 95°C 15min 预变性 不采集
PCR 40× 95°C 10sec 变性 不采集
50-60°C♣2 20sec 退火 不采集
72°C 20-32sec* 延伸 采集
熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage)

           3.请按照仪器使用说明书进行实验操作,不同型号仪器的时间设定*如下,
Roche LightCycler/ LightCycler 480 20sec
ABI 7500 Fast/7900HT/7900HT Fast/ViiA 7;StepOne/StepOnePlus 30sec
ABI 7000/7300 31sec
ABI 7500 32sec
 注意:♣1 常规使用60℃退火温度扩增;如需要优化,可尝试在60-66℃ 范围内进行。
            ♣2 常规引物退火温度比引物的解链温度(Tm)低5℃,如引物碱基数较少,可适当提高退火温度提高PCR特异性;如果碱基数较多,则可适当减低退火温度。
           4.盖上反应管,并瞬时离心确保组成混匀。
           5.将反应体系置于荧光定量PCR仪中,开始反应。

常见问题及处理方案:
无扩增曲线出现 A.反应循环数不够;
B.反应循环数过多,增加背景信号;
C.程序中未设置信号采集步骤;
D.引物降解;
E.模板浓度过低;
F.模板降解。
扩增曲线异常 A.曲线不光滑:需提高模板浓度重复实验,或确认ROX与机型是否匹配;
B.曲线断裂或下滑:需调整模板浓度,或减小基线终点,重新分析数据;
C.曲线骤降:检查反应管内是否有气泡。
CT值异常 A.出现太晚
(1)尝试三步扩增法,优化反应条件或重新设计引物,提高扩增效率;
(2)减少稀释度重复实验,提高模板浓度;
(3)重新制备模板,确认模板是否降解;
(4)评估PCR产品是否在80~150bp,防止过长;
(5)加到模板稀释倍数,或重新制备模板重复实验,防止体系中存在由模板带入的PCR抑制剂。
B.阴性对照中出现扩增带
(1)反应体系污染;
(2)引物二聚体干扰。
熔解曲线异常 A.引物设计不适宜;
B.引物浓度过高;
C.cDNA模板有基因组污染。
实验重复性差 A.加样误差;
B.标准品降解;
C.模板浓度不适宜;
E.PCR仪模块内置温度不一致。
 
本产品仅供科研使用,不得用于临床诊断!